Virtavesien lajit ja elinympäristöt ovat uhanalaistuneet Suomessa ja maailmanlaajuisesti. Siksi on tärkeää, että vielä vapaana virtaavien jokien suojelu jatkuu.
Sierilä, Kemijoki
Suomesta löytyy vielä suojelemattomia jokijaksoja, joita uhkaa voimalarakentaminen. Rovaniemelle 1950-luvulta lähtien kaavailtu Sierilän voimalaitos kahlitsisi Kemijoen viimeisen vapaan osuuden. Alueella esiintyy virtavesien ja rantojen uhanalaisia lajeja kuten jokihelmisimpukka ja apilakirjokääriäinen, sekä uhanalaisia luontotyyppejä. Uuden lajien ja luontotyyppien uhanalaisuutta koskevan tiedon valossa Sierilää ei pitäisi rakentaa.
Vuotos, Kemijoki
Edesmenneen Vuotoksen allashankkeen sijoittuminen Lapissa ja peruskarttalehdellä. Lähde: Lindholm, T. (toim) 2003: Vuotoksen alueen luonto. Suomen ympäristö 635. Suomen ympäristökeskus.
Myös suojeltu virtavesiluonto voi olla rakentamisuhan alla. Lappiin kaavailtu Vuotoksen eli Kemihaaran tekoallas oli vireillä vuosikymmeniä Kemijoki Oy:n tai Lapin liiton toimesta, laajimmillaan lähes 250 neliökilometrin laajuisena. Altaan alle olisi jäänyt vapaana virtaavia osuuksia Kemijoesta ja Vuotosjoesta sekä Kemihaaran soiden Natura 2000 -alue. Altaan rakentamiseksi etsittiin yhteiskunnallisesti merkittäviä syitä kuten Rovaniemen tulvasuojelu. Valtioneuvosto epäsi Natura-poikkeaman hankkeelta talvella 2018.